Die Friedhofkommission hat die Aufsicht über den Unterhalt der Friedhöfe und der Friedhofgebäude. Der Kommission gehören zwei Mitglieder des Stadtrates, je eine Vertretung der Friedhöfe Amriswil, Hagenwil und Oberaach sowie ebenfalls je eine Vertretung der evangelischen und der katholischen Kirchgemeinde an.